De første celler, der er ramt af Ebola- viruset, er vigtige for immunforsvaret af det inficerede individ. Mikroorganismen forhindrer især udløsningen af en reaktion af monocytter, makrofager og dendritiske celler. Disse celler erkender som regel, at noget udenlandsk er kommet ind i kroppen, så de har den afgørende opgave at aktivere immunsystemet .
Det følger heraf, at infektionen gør det vanskeligt at udvikle et effektivt svar til bekæmpelse af Ebola-viruset, som således kan formere sig for at invadere hovedorganerne i kroppen og efterlader en lille chance for overlevelse.