Diagnosen af afrikansk trypanosomiasis skal overvejes hos alle personer, der har opholdt sig i områder i Afrika, der anses for at være i fare for sygdommen.
Det første trin i sovesyge er svært at diagnosticere, da det forårsager uspecifikke symptomer, såsom feber og svaghed. Metoder anvendt til direkte identifikation af trypanosomer indbefatter analysen ved lysmikroskopi af blodprøver (smear eller tykt fald) eller lymfeknude aspiration. Andre ikke-specifikke laboratorieresultater viser pancytopeni, forhøjet VES og PCR og forhøjede IgM-niveauer.
Når parasitten invaderer centralnervesystemet og patienter begynder at manifestere neurologiske og psykiatriske symptomer (dårlig motorisk koordinering, desorientering, krampe og søvnforstyrrelser), kræver den diagnostiske vurdering en analyse af cerebrospinalvæske . Undersøgelsen af væsken gør det muligt at isolere trypanosomer og fremhæve høje niveauer af lymfocytter, totale proteiner, en markant stigning i IgM og de karakteristiske Mott-celler (plasmaceller med cytoplasmatiske vakuoler indeholdende immunoglobuliner).
