Almindelige aminosyrer og proteinsyntese
De aminosyrer, der forekommer hyppigst i proteinkonstruktionerne af levende organismer kaldes almindelige aminosyrer eller proteinogener. Selv om mere end 500 typer af aminosyrer er kendte i naturen, er der kun tyve, som vi kalder almindelige. Sammen med disse er der nogle mere sjældne, kaldet lejlighedsvise, som generelt stammer fra metabolismen af almindelige dem efter deres inkorporering i proteinkæden. I collagen findes for eksempel lysin og prolin, to almindelige aminosyrer, i den hydroxylerede form (hydroxyprolin og hydroxylisin).
De fleste af de andre ikke-almindelige aminosyrer falder hovedsageligt i konstitutionen af enzymer og hormoner af protein natur eller snarere peptid (husk at for at blive betragtet som sådan, skal et protein bestå af mere end 100 aminosyrer, mens man danner en oligo og et polypeptid er tilstrækkeligt fra 2 til 9 og fra 10 til 100).
Blandt de 20 almindelige aminosyrer huskes
Alanin, Arginin, Asparagin, Aspartinsyre, Cystein, Glycin, Glutaminsyre, Glutamin, Histidin, Isoleucin, Leucin, Lysin, Methionin, Phenylalanin, Prolin, Serin, Threonin, Tryptophan, Tyrosin, Valin
Eksempler på ikke-almindelige aminosyrer er:
carnitin (involveret i transport af langkædede fedtsyrer inde i mitokondrier, hvor de er vant til at producere energi);
ornithin, citrullin og homocystein (deltager i metabolisme af aminosyrer - urinstofcyklus);
hydroxyprolin og hydroxylisin (en del af sammensætningen af collagen og nogle proteiner);
sarcosin (eller methylglycin).
Nogle aminosyrer kan også have kommerciel eller farmakologisk betydning.
- Natriumglutamat anvendes i fødevareindustrien som smagsforstærker (se lagerbeholder).
- L-dihydroxyphenylalanin (L-DOPA) er et lægemiddel der anvendes til behandling af Parkinsons sygdom.
- 5-hydroxytryptophan (5-HTP) er blevet anvendt til behandling af neurologiske symptomer forbundet med phenylketonuri (en arvelig metabolisk sygdom, der forhindrer anvendelsen af phenylalanin, en essentiel aminosyre på grund af særlige enzymmangler, ophobning af phenylalanin i vævene er det ansvarlig for alvorlig skade på hud og neurologi).
Planter og bakterier er i stand til at producere bestemte aminosyrer, som kan findes i peptidantibiotika, såsom nisin og alameticin.
Essentielle aminosyrer
Nogle af de 20 almindelige aminosyrer kaldes essentielle, da de ikke kan syntetiseres af kroppen fra andre forbindelser, men skal tages sammen med mad.
For mennesker er disse phenylalanin, leucin, isucin, lysin, methionin, threonin, tryptofan, valin og, hos børn, histidin og arginin.
Almindelige aminosyrer, kemiske egenskaber
På basis af de radikale R's kemiske egenskaber (gruppe af atomer, der danner en ikke meget lang kæde), kan aminosyrerne opdeles i forskellige kategorier.
Aminosyrer med apolær R (ikke i stand til at danne hydrogenbindinger):
med alifatisk kæde: alanin, leucin, isoleucin, valin, prolin
med aromatisk kæde: phenylalanin, tryptophan
med kæde indeholdende et svovlatom: methionin
Aminosyrer med polær R:
med OH-gruppe: serin, threonin, tyrosin
med SH-gruppe: cystein
med CO-NH2- gruppe : asparagin, glutamin
med H: glycin (den eneste ikke-chirale aminosyre)
Aminosyrer med basisk R:
lysin, arginin, histidin
Aminosyrer med R-syre:
glutaminsyre, asparaginsyre
