Afrikansk trypanosomiasis er for det meste kontraheret af bid af en inficeret tsetse-flyve . Imidlertid er der også mulighed for lodret transmission fra moder til barn under graviditet. Trypanosome kan faktisk krydse moderkagen og inficere fosteret. Overførslen gennem andre blodsugende insekter er ikke udelukket, selvom denne mekanisme fortsat skal afklares.
Tilfældige infektioner har fundet sted mellem sundhedspersonale og laboratorier i analyselaboratorier efter punkteringer med forurenede nåle .
