Mojito er en typisk Havana-drink, selv om det præcise sted, hvor denne drikkes fødsel fandt sted, stadig er genstand for diskussion.
Ifølge resultaterne ser det ud til, at der i Cuba i det 16. århundrede blev oprettet en drink kaldet "El Draque" efter Francis Drake kom. I 1586, efter navlernes indtræden af bosætterne i Cartagena de Indias, ledede de til Havana. Desværre begyndte forskellige sygdomme at decimere besætningen (især skørbugt), så en lille gruppe søfolk landede til Cuba for at tage i besiddelse af de populære lægemidler, der er typiske for indfødte. De vendte tilbage med "aguardiente de cana" (en slags rom), lime, mynte og sukkerrørjuice. Lime ville i sig selv have været tilstrækkeligt til at helbrede skørbugt, men hvad ingen kunne forestille sig, var, at det var (som med mynte og sukkerrørjuice) ingredienser designet til at rette op på den ubehagelige smag af "mirakelalkoholen ": El Draque
Den faktiske Mojito blev i stedet døbt (sandsynligvis) af den cubanske befolkning (et par årtier senere), baseret på substantivet "Mojo", et typisk kalkbaseret krydderi. En anden teori er, at den kommer fra "mojadito", som betyder "lidt våd", eller simpelthen fra "mojado" eller "våd".
