Diagnosen af gul feber er ikke enkel, da det kliniske billede kan fremstå med et symptom, der er vanskeligt at skelne fra andre virale hæmoragiske feber, malaria, tyfusfeber, leptospirose, dengue og hepatitis.
Derfor bør man fejle gul feber hos patienter i et endemisk område, der udvikler en pludselig feber med bradykardi og gulsot. Laboratorieundersøgelser udført straks på et kvalificeret hospital vil gøre det muligt for diagnosen at blive bekræftet eller udelukket.
Undersøgelserne, der er nyttige til dette formål, omfatter blodtælling, urinalyse, leverfunktionstest, cellekulturer og retrotranskription med polymerasekædereaktion (RT-PCR). Diagnostisk bekræftelse tilvejebringes ved tilstedeværelsen af specifikke antistoffer detekteret ved serologiske test, såsom ELISA (enzymbundet immunosorbentassay).
